Программы Фонда по поддержке малого и среднего предпринимательства предусматривают предоставление поручительств за малые и средние предприятия, а также организацию инфраструктуры поддержки малого и среднего предпринимательства, привлекающего кредиты и банковское гарантии. В свою очередь Транскапиталбанк осуществляет непосредственное кредитование и выдачу банковских гарантий представителям малого и среднего бизнеса г. Москвы по программам Фонда.